
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸绘制蛋白质组学产品,实现1000+高妙度装饰位点检测,稳定性高初现精典靶点,全八卦方位生信定性分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“感觉”到“效验”全注意事项服务项目,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实验操作流程图
02、监测数据统计
03、经“点”再次出现
在监测信息中,排除众多文献资料中报到的经点靶点下列不属于衣康酸淡化语位点,如第一次个被发掘的衣康酸共价淡化语淀粉酶质KEAP1,和糖酵解环路中的3个关健酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,甚至炎性小体组成了淀粉酶质NLRP3和体细胞病变过程中中的关健淀粉酶质RIPK3等,其质谱图一下图图示。
04、产品设备特殊性
1.多种质控
商业服务化特异形测试探针孵育、SDS-PAGE检验、WB核验、样板涉及到的性讲解等几坐向检验,确定新项目毕竟可靠的性。2.高安全性能质谱器材手机平台
在Orbitrap Astral全新一代的名将高粪便质谱仪金刚萨垛下,构建衣康酸性反应突显位点及蛋白酶认定新深度的,推动科学学设计新表明。3.全标准流程一坐式服务保障
立于拜谱生物制品成熟的的实验英文网络平台,可供给“神经细胞训练→探头孵育→WB检查→高妙度衣康过酸修饰语检查→炫舞心悦生信研究分析→特殊位点PRM验证通过”全具体流程的服务,省时杠杆原理更实惠。05、解析信息内容(要素)
06、利用方向盘
PART 2、期刊论文分享图片
学术论文一
英文音标宝贝标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
常常大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
深入分析东西:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
医学文献二
日语文章标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文名字小标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
科研资源:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、案例库衍生物策略
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13有着很强的底物运用性能,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物体衣康硝化作用修饰语组测量数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应装饰(下列图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
成为TCA不断循环中的在期间排泄物,衣康酸缓解排泄、免疫检测系统系统和支原体感染病变互相的互为能力,为改善免疫检测系统系统支原体感染病变性疾患提高了带替改善营销策略。衣康酸节构中的亲电性α,β-不饱合羧酸节构能对淀粉酶质上的亲水性半胱氨酸残基确定烷基化绘制(迈克尔增益表现),这样汉语翻译后绘制被叫作“衣康酸绘制(itaconation)”,以致印象淀粉酶质的功能,政策调控免疫检测系统系统初次应答和排泄方式,为多类疾患药剂新产品开发提高新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医药学绝对是降钙素原检测靶向疗法产生组(QMT1000)或能源排泄靶点排泄组车辆对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
关联性文献资料
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.