草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿机设计最先见的肠子疾病这其中之一。肾策划 中CaOx多晶体过饱和状态基性岩会引发肾小管组织细胞损害和凋亡，最终得以引发肾结石的出现。短链皮脂酸由肠子内活性污泥法大肠杆菌酵营养碳水化合物材料出现，不只在线条肠子防御设计中切实充分调动意义，还在机设计质量上也切实充分调动重中之重意义。这其中，丁酸是最多种的短链皮脂酸，包括免疫系统可抑制和免疫系统可抑制意义,本理论研究研究综述丁酸对CaOx肾结石的意义简答不确定靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院门诊泌尿五官科吴忠院士、周子健硕士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠客座教授、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网临床药理学业务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客服公司的：华山大医院 深入分析女朋友：大鼠、HK-2上皮细胞 排序数据信息：比对组（Con）、沙盘模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱保证技巧：网格临床药理学查重

基本思路注意事项图

分析的结果

设计方案人员管理先是构筑大鼠模特，完成女性生理什么是生化完成指标和组建病理学学固色等设计方案伎俩显示丁酸是可以下降CaOx模特大鼠肾CaOx单晶体的导致和损害，提高CaOx模特大鼠的感染损害和腐蚀物资的过度的表答。还有，丁酸还可调节草酸诱发的HK-2组织血细胞损害、腐蚀应激反应和组织血细胞凋亡。 为与探讨丁酸机构和靶DNA网格，实验人从PubChem提高丁酸和丁酸酯的二维和三维图像机构（图1A）。完成PharmMapper数据源表格表格库和Uniprot数据源表格表格库外理后共需求出116个丁酸靶DNA供进两步分享。将DNA表单添加STRING数据源表格表格库，使用PPI网格分享。Cytoscape拿出了编排的前20的联络线靶DNA的详细这说明网格图，分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这部分联络线DNA与网格中的其它DNA均体现出某种的一些性，这说明这部分DNA也许 切实更好地发挥着联动意义。GO和KEGG分享体现了丁酸联络线DNA的一些行业和生态学学职能（图1C）。联络线DNA首要与类固醇荷尔蒙对答、空气氧化的应激性的化学反应迟钝对答、物理活化氧组织细胞对类固醇荷尔蒙畅快的的化学反应迟钝或者对偏酸物理物料的的化学反应迟钝关于。与此同时所写，这部分联络线DNA首要参与性了空气氧化的应激性的化学反应迟钝和对物理活化氧的生态学的化学反应迟钝步骤，是肾结石构成机能中最重要性性的行业，这阐明丁酸也许 在肾结石中切实更好地发挥最重要性意义。

图1| 丁酸节构与靶什么是基因手机网络进行分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进这一步经历丁酸对CaOx肾结石那就是切靶表观遗传，学习人士合理利用GEO统计资料统计库对GSE73680中良好相较比较与CaOx肾结石朋友的表观遗传不同之处做了学习。相较比较组与CaOx结石朋友的同质性性不同之处呈现出表观遗传（DEGs）产前筛查条件为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个表观遗传的发生同质性变化规律，这其中3379个（89.4%）表观遗传呈现出调涨，404个（10.6%）表观遗传呈现出变动（图2A）。对DEGs做聚类分析法了解法了解，热图体现 了前10个被选中DEGs的二维细化聚类分析法了解法特征描述（图2B）。马上又，学习人士可以通过GeneCards统计资料统计库人工工资监定了370个可能会与CaOx肾结石一些的表观遗传，网站排名前20位的估计表观遗传还有一些性评分系统就像文中2C提示。方便查到丁酸冶疗CaOx肾结石的要素靶点，学习人士将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些表观遗传处里获取半个个Venn图。决定性，CYP2C9被明确为丁酸影向CaOx肾结石的意向靶点(图2D)。还有，学习人士还做了丁酸与CYP2C9的分子式对接的，CYP2C9的这几个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接功能，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在合理利用网上临床药理学预测分析CYP2C9是丁酸引响CaOx肾结石的靶染色体后，的研究人工还进行生殖上皮细胞实验所得知了CYP2C9可影响草酸引发的HK-2生殖上皮细胞的ROS程度、真菌感染影响和凋亡。

图2| 大多据库共同解析分析预测CYP2C9是丁酸用处于CaOx肾结石的靶人类基因

科学研究的结果

本学习第一得知丁酸在身体外和休内均能可能够克制CaOx肾结石模板的空气氧化反应应激性状态和细菌感染病变挫伤，那么确认网站药剂学学筛分达到丁酸影向CaOx肾结石的隐性靶点——CYP2C9，最好确认細胞實驗证明CYP2C9在草酸盐帮助的HK-2細胞ROS横向、细菌感染病变挫伤和凋亡。这部分得知意味着丁酸将会确认可能够克制CYP2C9来可能够克制CaOx肾结石的空气氧化反应应激性状态，缓减细菌感染病变挫伤。一种的过程中拜谱生物的技术学提供了了网站药剂学学技術提供服务项目，另外拜谱生物的技术学可的提升心智成熟健全的人类基因组学、淀粉酶质组学、分泌组学等多个学物料及技術提供服务项目，祝贺拨打电话顾问！ 选取文献资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.