
近日,上海医科本科大学第一个加盟医院口腔科王学浩工程院院士专业团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向治疗能量场细胞代谢检测分析服务。
用英语版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
潜在客户院校:南京医科大学
的研究材料:细胞
拜谱打造工作:转录组测序+核蛋白互作组+靶向药物势能新陈代谢组
方法自驾线路:
研究方案结局
01、YBX1被判定为HCC中糖酵解的至关重要遗传基因
本理论研究抓取HCC良性恶性恶性肺部肿瘤子样本(n=7)的单生殖受损细胞核RNA测序数据源资料集开展进行研究,表明糖酵解吸附性注意集结在良性恶性恶性肺部肿瘤生殖受损细胞核中,hdWGCNA进行研究识别图片出9个表观遗传模快(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的环境进行研究判别YBX1为独自环境风险性客观因素(图1H)。进的一步紧密结合IHC、WB实验操作和良性恶性恶性肺部肿瘤聚集与相邻非良性恶性恶性肺部肿瘤聚集的空间转录组学数据源资料集确认YBX1是肝生殖受损细胞核癌制疗的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判断为缓解HCC组织糖酵解的重点情况
02、YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗能力代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1结合在一起并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷酸性反应,最后有利于促进其核转位
进步判断YBX1的O-GlcNAc糖基化是否是应响其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC血上皮细胞中或用OGT克药制剂OSMI-1治理 ,YBX1血清品质为相关性拉低,YBX1磷酸性反应为相关性限制(图4A-C)。IP调查信息显示,在是一样的的Flag-YBX1底物品质下,YBX1-WT的磷酸性反应品质为相关性多于YBX1-T57A,表示磷酸性反应的新增并不是仅是这是由于会高的YBX1血清形容(图4D)。剥离了核和质成分发觉TMG治理 的HCC血上皮细胞中YBX1核形容的偏高(图4E-F),进步发觉YBX1磷酸性反应的核心调接因素是AKT(图4G-I)。许多发觉突出O-GlcNAc糖基化经由力促其磷酸性反应来开展YBX1血清安全稳判定并力促核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖不有益于其进三步造成磷硝化作用掩盖并还可以有利于其核转位
05、YBX1加速PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促使PKM2转录
06、YBX1 还可以提升组蛋白质乳过酸遮盖程度
科研看见YBX1敲低差异性降底球高血清乳硝化为用,愈加是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解可以抑溶液剂2-DG的科学实验灵魂都存在了糖酵解与组球血清乳硝化为用的简单绑定qq,可以可抑制糖酵解可差异性降底H3K18la质量(图6D)。PKM2过描述可逆反应转YBX1敲低而致的H3K18la的降低,到外源乳酸补救不仅能升级H3K18la,还持续性YBX1描述上涨,提示信息都存在顺向返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR灵魂都存在,H3K18la借助聚集于YBX1开始子简单加速其转录,该步骤受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),并看见P300 上涨是YBX1提高H3K18乳酰化为用的考核机制(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳硝化作用突显级别
句子个人总结
在这些钻研中简讯了YBX1在HCC中高表述出,有时候与糖酵揭秘切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc修饰语语,导致不稳核苷酸质并提高其表述出。这个修饰语语还提高网站YBX1在T57处的磷酸性反应,提高网站其核易位。如此,此种的过程增强学习了糖酵解相应的基因组组的转录并的刺激乳酸的引起。不但,YBX1激活卡P300的转录,而能驱动安装组核苷酸的乳酸性反应,非常是H3K18la,H3K18乳酸性反应顺向宏观调控YBX1基因组组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性双面馈环策略图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向疗法能量场代谢率组技术服务,拜谱生态学建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻译英语后呈现组学、分解组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参照文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.