
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱怪物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探析效果
科研员探究式渐渐冷冻箱的日子延迟鸡肉的洛氏强度、持反击式水轮机、成色、解离铁量、ROS、脂质过阳极金属氧化物、MDA、GSH和GPX4的水平来分析评估健身肌肉策划 細胞的铁意外死亡感觉。数据表现,冷冻箱的日子延迟后,鸡肉的洛氏强度在第5天和第6天特殊急剧下降;持水的能力大大减少;本色变深,失却色泽,鲜橙鲜红色转成暗橙鲜红色。虽然,解离铁、特异性氧和MDA的量特殊增强,細胞凋亡率特殊增大。 研发人工导出不一冷藏库时的健身力量图纸的蛋清质,第二做好SDS-PAGE定性介绍,蛋清质条带在不一時期分布不均不匀且类似于(图1a)。给出蛋清在不一图纸中的表达方式状况,定性介绍出现同种组图纸的中个数靠近于同种能力(图1b),说明怎么写健身力量图纸蛋清质还具有优良的组内类似于性和组间差距性。 蛋清质组学共监定会出1996种蛋清质。以B0为剖析组,挑选B1、B2、B4和B6中的蛋清使用文化差异化把你想形容出来出解析,共监定会到3715个DEPs。将火山图交互,并跟据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种基准解析DEP。结论把你想形容出来1c-f把你想形容出来,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别监定会出22、33、73和140个DEPs,另外分头别上浮6、11、32和815个,再降16、22、41和53个。聚类算法的办法风险评估了多种冷冻冷藏第一阶段力量安排中蛋清质的把你想形容出来出,结论屏幕上显示力量蛋清把你想形容出来出文化差异化跟随着存储時间的多而多(图1g)。
图1| 其他保鲜冷库事件的胸肌样板血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同冷藏箱周期的身体肌肉合格品差别核蛋白研究分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡蛋白酶肽的PRM化学发光法探讨(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 鉴于KEGG聚集差别的表明球蛋白的铁牺牲管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT降钙素原检测球氨基酸组学技巧服務,拜谱生物技术性已研发项目管理到位并成立了不断完善熟的转录组学、球球蛋白组学、产生组学以其几组学共同产品设备技巧服務体制,欢迎致电咨询!
对比论文文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.